Klorheksidin juga dapat dianggap sebagai bahan klasik, meskipun dikembangkan jauh lebih baru daripada hipoklorit. Ia mulai digunakan di Inggris pada tahun 1953 sebagai antiseptik, disinfektan, pengobatan infeksi kulit, mata dan tenggorokan. Ini adalah antimikroba spektrum luas yang telah membuktikan efektivitasnya terhadap bakteri gram dan gram + dan tidak hanya digunakan sebagai irigan endodontik, tetapi juga digunakan dalam terapi periodontal gigi, implantologi dan kariologi untuk kontrol plak gigi, karena mekanisme aksinya membuatnya menempel pada area membran sel dengan muatan negatif dan menyebabkan lisis sel.
Tergantung pada konsentrasi yang digunakan, efek klorheksidin dapat bersifat bakteriostatik atau bakterisidal.
Klorheksidin pada konsentrasi tinggi > Efek bakterisidal
Ia memiliki kemampuan merusak membran sel dengan bertindak sebagai deterjen dan menyebabkan pengendapan sitoplasma.
Klorheksidin pada konsentrasi rendah > Efek bakteriostatik
Ia menyebabkan pelepasan zat-zat seperti kalium dan fosforus yang memiliki berat molekul rendah, tetapi tidak merusak sel secara ireversibel. Ia juga mampu mengubah metabolisme bakteri dengan mencegah transportasi sistem fosfotransferase gula (PTS) dan menghambat produksi asam pada beberapa bakteri.
Klorheksidin juga memiliki sifat antimikroba yang sangat menarik yaitu substantivitas antimikroba, yaitu ia menempel pada dentin menjaga aktivitas antimikroba yang berkelanjutan, oleh karena itu, digunakan sebagai obat/irigan intrakanal ia memiliki kemampuan untuk menunda rekontaminasi koronal dari sistem kanal. Ia ideal terutama dalam kasus retratmen endodontik.
Klorheksidin yang digunakan sebagai irigan endodontik, baik dalam bentuk cair maupun gel, memiliki sifat antibakteri yang berbeda tergantung pada konsentrasinya. Dibandingkan dengan hipoklorit, sifat-sifat ini tidak memiliki perbedaan yang signifikan, namun, klorheksidin tidak mampu melarutkan jaringan dan oleh karena itu natrium hipoklorit masih merupakan pilihan yang lebih baik.
Kadang-kadang direkomendasikan sebuah protokol irigasi yang harus diambil tindakan pencegahan tertentu karena interaksi kimia yang dapat terjadi:
- Siram dengan natrium hipoklorit untuk melarutkan komponen organik.
- Siram dengan EDTA untuk menghilangkan smear layer.
- Siram dengan klorheksidin untuk meningkatkan spektrum aktivitas antimikroba dan menambah substantivitas.
Ketika mencampurkan natrium hipoklorit dengan klorheksidin, reaksi asam-basa terjadi yang membentuk presipitat netral yang tidak larut yang diduga mengganggu penyegelan apikal yang tepat, dan perubahan warna juga terjadi. Di sisi lain, campuran klorheksidin dan EDTA membentuk garam. Oleh karena itu, disarankan untuk mengeringkan sebaik mungkin dengan kertas poin sebelum irigasi akhir dengan klorheksidin.
Tindakan pencegahan yang perlu dipertimbangkan adalah bahwa klorheksidin dapat menyebabkan reaksi alergi pada sekitar 2% pasien, meskipun data ini mempertimbangkan klorheksidin yang digunakan pada kulit dan bukan pada saluran akar.